Lors d’une attaque par un agent pathogène, un mécanisme de défense systémique, la SAR (Systemic Acquired Resistance), se met en place pour permettre une défense ultérieure contre un large spectre de pathogènes. Des micro-organismes bénéfiques (MOB) sont également capables d’induire un mécanisme de résistance induite, on parle alors d’ISR (Induced Systemic Resistance). Les MOB prennent une place de plus en plus importante dans les approches de protection intégrée des plantes.