La forte hausse de la demande en produits issus de l’agriculture biologique (AB) s’accompagne d’une augmentation importante des surfaces cultivées dédiées à ce type de pratiques agricoles en Europe (+25% entre 2020 et 2017). Or, si les agriculteurs Bio peuvent encore s’approvisionner en semences conventionnelles pour certaines espèces et sous certaines conditions, un durcissement de la réglementation est attendu avec la fin des dérogations d’ici 2035. Il devient donc urgent de produire des variétés qui respectent le cahier des charges de l’agriculture biologique, depuis la création variétale jusqu’à la production de semences. Qu’est-ce qui caractérise une variété adaptée à l’AB ? Quelles sont les techniques autorisées en création variétale pour l’AB ? Ces questions portent à la fois sur les programmes d’amélioration variétale et sur la réglementation du commerce des variétés. Pour y répondre, les acteurs de l’industrie semencière d’une part, et la commission européenne, d’autre part, investissent largement dans la recherche et l’expérimentation au travers de projets de grande ampleur.

Les données de génomique dans le domaine du végétal deviennent de plus en plus accessibles du fait de l’essor constant des technologies de séquençage et notamment de l’apparition et de l’amélioration du séquençage long fragment, ainsi qu’un coût de séquençage de plus en plus abordable.

Les 04 et 05 novembre 2019, un séminaire de la section « outils moléculaires en appui à la création variétale » de l’ASF (Association des Sélectionneurs Français), animée par Vegenov, a été organisé au Genoscope à Evry. Deux demi-journées de discussions ont permis de faire un point sur les nouvelles technologies de séquençage et leur utilisation concrète dans le cadre de programmes de sélection végétale.

Dans des précédents billets, j’ai évoqué deux stratégies d’amélioration des plantes très utilisées : l’hybridation inter-spécifique et la fixation du matériel génétique par haplométhodes .Dans les deux cas, la question de la fertilité des plantes obtenues se pose très vite.Celle-ci est directement liée au niveau de ploïdie des plantes générées.

Les programmes de sélection de nouvelles variétés assistés par marqueurs nécessitent l’utilisation d’un grand nombre de marqueurs moléculaires. Les 17 et 18 novembre 2016, un séminaire de la section « Outils moléculaires en appui à la création variétale » de l’Association des Sélectionneurs Français, animée par Vegenov, a été organisé à l’INRA de Toulouse. Deux demi-journées ont permis de faire un point sur les techniques de GBS et leur utilisation concrète dans le cadre de projets de sélection végétale.

Les technologies de génotypage et de séquençage, de plus en plus utilisées par les sélectionneurs pour la création de nouvelles variétés, évoluent très rapidement. Afin de pouvoir faire un point sur les nouvelles technologies dans le cadre de programmes de sélection, la section « Outils moléculaires en appui à la création variétale » de l’ASF (Association des Sélectionneurs Français) a organisé les 7 et 8 octobre 2014, à l’INRA de Clermont Ferrand, deux demi-journées sur ce thème.