Les méthodes les plus répandues pour obtenir des plantes haploïdes doublées consistent à mettre en culture les gamètes mâles ou femelles en laboratoire. Ces techniques in vitro, appelées respectivement androgenèse in vitro pour les gamètes mâles et gynogenèse in vitro pour les gamètes femelles, interrompent le développement normal de ces cellules pour les réorienter vers la formation d’embryons sans avoir besoin de fécondation, ce qui permet le développement d’individus haploïdes ou haploïdes doublés.

Dans un monde confronté à des pressions croissantes liées au changement climatique, à la réduction des intrants de synthèse et à la sécurité alimentaire, l’amélioration des plantes joue un rôle crucial pour répondre aux attentes sociétales. Au cœur de ce processus, le phénotypage permet de décrire le potentiel génétique des plantes dans leur environnement en les confrontant à divers stress biotiques ou abiotiques, différentes pratiques culturales etc. Cela permet ainsi de sélectionner des génétiques d’intérêt pour créer des variétés plus résistantes, plus productives, et mieux adaptées à ces nouveaux défis.

Le projet collaboratif BRESOV (“Breeding for Resilient, Efficient and Sustainable Organic Vegetable production”, 2018-2023), financé par le programme de recherche et d’innovation Horizon2020 de l’Union européenne et coordonné par l’Université de Catane (UNICT, Italie) s’est achevé le 30 avril. Le rapport de la dernière période du projet ainsi que les derniers livrables sont en cours de relecture par le comité d’experts de la Commission européenne.

La forte hausse de la demande en produits issus de l’agriculture biologique (AB) s’accompagne d’une augmentation importante des surfaces cultivées dédiées à ce type de pratiques agricoles en Europe (+25% entre 2020 et 2017). Or, si les agriculteurs Bio peuvent encore s’approvisionner en semences conventionnelles pour certaines espèces et sous certaines conditions, un durcissement de la réglementation est attendu avec la fin des dérogations d’ici 2035. Il devient donc urgent de produire des variétés qui respectent le cahier des charges de l’agriculture biologique, depuis la création variétale jusqu’à la production de semences. Qu’est-ce qui caractérise une variété adaptée à l’AB ? Quelles sont les techniques autorisées en création variétale pour l’AB ? Ces questions portent à la fois sur les programmes d’amélioration variétale et sur la réglementation du commerce des variétés. Pour y répondre, les acteurs de l’industrie semencière d’une part, et la commission européenne, d’autre part, investissent largement dans la recherche et l’expérimentation au travers de projets de grande ampleur.

Les données de génomique dans le domaine du végétal deviennent de plus en plus accessibles du fait de l’essor constant des technologies de séquençage et notamment de l’apparition et de l’amélioration du séquençage long fragment, ainsi qu’un coût de séquençage de plus en plus abordable.

Les 04 et 05 novembre 2019, un séminaire de la section « outils moléculaires en appui à la création variétale » de l’ASF (Association des Sélectionneurs Français), animée par Vegenov, a été organisé au Genoscope à Evry. Deux demi-journées de discussions ont permis de faire un point sur les nouvelles technologies de séquençage et leur utilisation concrète dans le cadre de programmes de sélection végétale.