Les données de génomique dans le domaine du végétal deviennent de plus en plus accessibles du fait de l’essor constant des technologies de séquençage et notamment de l’apparition et de l’amélioration du séquençage long fragment, ainsi qu’un coût de séquençage de plus en plus abordable.

Les 04 et 05 novembre 2019, un séminaire de la section « outils moléculaires en appui à la création variétale » de l’ASF (Association des Sélectionneurs Français), animée par Vegenov, a été organisé au Genoscope à Evry. Deux demi-journées de discussions ont permis de faire un point sur les nouvelles technologies de séquençage et leur utilisation concrète dans le cadre de programmes de sélection végétale.

Les semences sont à l’amont de tout le secteur agricole et agro-alimentaire. Leur rôle est donc stratégique dans un contexte de fort développement démographique mondial, de réchauffement climatique, mais aussi de montée des exigences de qualité et de traçabilité des produits agricoles et agro-alimentaires. Faisons le point sur ce secteur souvent méconnu alors qu’il s’agit d’un des fleurons de l’industrie française.

Il est reconnu que la mise au point de techniques de culture in vitro nécessite beaucoup de savoir-faire et d’expériences empiriques. Souvent, ce sont des modifications mineures sur des protocoles déjà existants qui sont apportées mais qui ne permettent pas de résoudre des problèmes physiologiques, aboutissant à des pertes de rendement. C’est justement la complexité des systèmes de culture in vitro et, en parallèle, la possibilité qu’il y a d’en contrôler tous les paramètres qui rendent la démarche mathématique de planification expérimentale tout à fait appropriée à cette biotechnologie.

Depuis 2012, une technologie d’ingénierie génomique fait beaucoup parler d’elle ! Simple à mettre en place et peu onéreuse, CRISPR-Cas9 est un système qui permet de modifier le génome. Stimuler, inhiber ou remplacer un gène par un autre devient avec cette technique un jeu d’enfant. De nombreuses applications ont déjà été testées notamment dans le domaine du végétal. Focus sur cette technique qui fait le buzz !

La demande en produits issus de l’agriculture biologique croit fortement depuis quelques années. En réponse, les conversions d’exploitations agricoles ne cessent d’augmenter. Cependant, les agriculteurs se trouvent souvent démunis lorsqu’il s’agit de trouver des variétés adaptées à l’agriculture biologique. Afin de pallier ce manque, l’Europe finance des projets de recherche appliquée tels que le projet BRESOV. Objectif de ce projet qui vient de démarrer : mettre à disposition des producteurs bio des variétés de tomate, brocoli et haricot vert adaptées à l’agriculture biologique et leur permettre de disposer de semences en quantité et qualité suffisante.

Continuer la lecture